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Face aux pandémies, les sciences de l’écologie sont plus que jamais nécessaires

 

CNRS Le Journal (30/03/20) par un collectif de scientifiques du Centre de Recherches en Ecologie et Evolution de la Santé (CREES)
 
Dans cette tribune, un collectif de scientifiques plaide l'importance de la recherche en écologie et évolution pour comprendre les phénomènes d'émergence de maladies infectieuses, et anticiper les menaces futures.

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Modélisation épidémiologique du COVID-19

 

Précisions

 

Ces rapports sont avant tout à des fins pédagogiques. Ils ne sauraient remplacer des instructions nationales et internationtales. En particulier, les hypothèses faites sont souvent volontairement simplificatrices pour plus de clarté.

Ce travail est réalisé par des modélisateurs et modélisatrices de l'équipe ETE du laboratoire MIVEGEC (CNRS, IRD, Université de Montpellier).

À ce jour ces travaux n'ont reçu aucun financement dédié et se veulent indépendants de toute entité publique ou privée.

Rapports

 

 

 

    • 24 mars 2020 : Rapport 3 sur un modèle de propagation de l'épidémie de COVID-19 (calcul de R0 et illustration des mesures de contrôle). Les fichiers bruts et les scripts R sont téléchargeable en format .zip

 

    • 30 mars 2020 : Rapport 4 sur l'analyse phylodynamique des génomes viraux (calcul de la date d'origine en France et de son temps de doublement). Les fichiers bruts et les scripts R sont téléchargeable en format .zip

Travaux scientifiques

 

    • [preprint] Ramsès Djidjou-Demasse, Yannis Michalakis, Marc Choisy, Mircea T. Sofonea, Samuel Alizon (2020) Optimal COVID-19 epidemic control until vaccine deployment [PDF]

 

Quelques liens utiles sur l'épidémiologie et l'évolution du COVID-19

 

L'équipe

Le groupe de modélisation de l'équipe ETE est composée de Samuel Alizon, Thomas Bénéteau, Marc Choisy, Gonché Danesh, Ramsès Djidjou-Demasse, Baptiste Elie, Yannis Michalakis, Bastien Reyné, Quentin Richard, Christian Selinger, Mircea Sofonea.

Qu’est-ce que l'« immunité collective »
et
pourquoi c’est un pari très risqué ?

 

Article par Oihana GABRIEL en 20minutes le 30/03/20 avec Mircea SOFONEA

 

Alors que certains pays ont adopté la stratégie de l’immunité collective, avant de se raviser, focus sur cette méthode plutôt critiquée par les scientifiques

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Contact : Mircea SOFONEA

 

 

 

L’immunité collective peut-elle avoir raison de l’épidémie ?

 

Article par Martin LEGROS en Philosophie Magazine le 30/03/20 avec Mircea SOFONEA

 

Depuis que le Premier Ministre britannique Boris Johnson en a parlé pour justifier la politique initiale de laisser-faire de son pays face au Covid-19, la notion d’“immunité collective” est au cœur du débat. S’agit-il de sacrifier les plus faibles pour préserver le plus grand nombre dans une optique néodarwinienne ? Nous avons interrogé épidémiologistes et philosophes qui y voient plutôt un outil pour protéger l’ensemble de la société.

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Contact : Mircea SOFONEA

 

 

 

 

Phylodynamique du COVID-19 en France

 

Rapport par le groupe de modélisation de l’équipe ETE sur le site : alizon.ouvaton.org/

 

> Rapport4_Phylodynamique

 

Contact : Samuel ALIZON